Summary: Después de eso escribirás todo el CSS que quieras. Los archivos WordPress funciona más o menos como en esta imagen lo muestro: Ok, el archivo index.php se carga de llamar al archivo header.php, luego procesa el loop (o muestra el/los post/posts), después llama al archivo sidebar.php y por último al footer.php
Image Dimensions: 450 x 300
Image originally found here.